農林科技系是學院辦學歷史悠久、師資為雄厚的教學系之一。現開設有園林技術、植物保護、生物技術及應用、食品加工技術、園藝技術、林業技術和作物生產技術等7個，其中園林技術為重慶市級示范，植物保護為教育部支持建設。本系現有普通全日制在校學生1575人，專任教師48人，校內兼課教師9人，其中教授3名、副教授22名、高級實驗師2名、雙師素質教師39名、省部級教學名師2名、重慶市萬州區科技特派員5名、國家職業技能鑒定考評員13人，其中高級考評員9人。校外兼職教師36人，校外兼課教師15人。現建設有校內實訓中心3個，校內實訓室35個，校內實訓工場2個，實習實訓設備價值800余萬元；校外實訓基地52個。
目前，建設有市級優質資源共享課程2門（《園林樹木學》、《園林規劃設計》），院級精品課程10門（《園林工程》、《花卉生產技術》、《果樹生產技術》、《園林工程預決算》、《森林調查技術》、《園林植物栽培養護》、《園林植物保護》、《農作物有害生物防治技術》、《植物組織培養》、《植物化學保護》）。市級教學團隊1個（園林技術教學團隊），院級教學團隊1個（植物保護教學團隊）。
近兩年，系部教師公開發表論文累計80余篇，其中核心期刊36篇，主持科研及教改課題（項目）46項，其中重慶市級科技項目29項，已結題12項；重慶市級教改項目6項，已結題2項；萬州區科委科技項目6項。科研教改成果3項。主持編寫教材17本，其中校企合作開發教材15本。
2012年參加職業技能大賽獲得一等獎1項（植物組織培養項目），二等獎3項。2013年參加職業技能大賽獲得一等獎1項（茶葉中重金屬含量的檢測），二等獎2項。
